《第三军医大学学报》（半月刊）创刊于1979年，由第三军医大学主管、主办，国内外公开发行的综合性医药卫生类学术刊物。
《第三军医大学学报》主要栏目设有：专家论坛、论著（军事医学、基础医学、临床医学、药学、预防医学、检验医学、生物医学工程等）、技术方法、研究快报、短篇论著、经验交流、疑难病例、个案与短篇和学术之窗。创刊至今，坚持正确的办刊宗旨，以质量特色求生存，以社会效益求发展，在传播新理论、交流新经验、推广新技术、普及新知识等方面作出了积极贡献。
《第三军医大学学报》被北大1992版核心期刊、北大1996版核心期刊、北大2000版核心期刊、北大2004版核心期刊、北大2008版核心期刊收录。先后20余次获全国、全军、教育部和省、市科技期刊一、二等奖，2004年获全国高校学报一等奖。
第三军医大学学报杂志栏目设置专家论坛、论著（军事医学、基础医学、临床医学、药学、预防医学、检验医学、生物医学工程等）、研究快报、疑难病例和学术之窗。
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