《同济大学学报(医学版)》（双月刊）创刊于1980年，本刊是以基础医学与临床医学研究为主的综合性医学学术期刊，国内公开发行。中国科技论文统计源期刊，被重要数据库和文献期刊收录。主要栏目有：实验研究、调查研究、医工结合、临床研究、综述、技术方法及短篇报道等。
《同济大学学报(医学版)》以马克思列宁主义、毛泽东思想、邓小平理论和“三个代表”重要理论为指导，贯彻科学发展观，贯彻党的教育方针和“百花齐放、百家争鸣”的方针，主要反映本校的两个文明建设，刊发学术文章，反映科研成果，指导教学实践，交流科教学术信息，促进科教学术的繁荣发展。
《同济大学学报(医学版)》获上海市科技期刊；全国高校自然科学学报及教育部科技期刊三等奖；2004年全国高校科技期刊评比中荣获“编辑出版质量奖”、首届《中国学术期刊（光盘版）检索与评价数据规范》执行奖。
同济大学学报(医学版)杂志栏目设置基础研究、临床研究、经验交流、短篇报道、调查研究、叙评、综述
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